H/F Ingénieur d'études en RMN métabolomique

Les missions du poste

Nous sommes à la recherche d'un(e) ingénieur(e) d'études spécialisé(e) en biochimie analytique basée sur la résonance magnétique nucléaires (RMN) et appliquée à l'analyse des petites molécules pour des études de métabolomique. La personne recrutée sera particulièrement en charge de développer des approches de métabolomique par RMN sur des échantillons issus de cellules ASC cultivées dans différentes conditions. Ces développements concernent aussi bien la préparation des échantillons (milieux de culture et d'extraits cellulaires), l'analyse par RMN 1D et 2D, ainsi que de l'interprétation des résultats. Ce travail sera réalisé dans l'équipe METABOLINK de l'institut RESTORE (www.restore-lab.fr) situé sur le site Langlade de Toulouse et sur la plateforme MetaToul-MetaboHUB (www.metatoul.fr) au sein de Toulouse Biotechnology Institute (UMR CNRS 5504, Toulouse).

Activités

Activités principales :
- Développer une stratégie de métabolomique par RMN adaptée à l’étude du métabolisme de cellules ASC
- Participer à la collecte et au suivi des échantillons biologiques (échantillons de milieux de culture et d’extraits cellulaires),- Mettre en place et réaliser des analyses par RMN 1D et 2D de ces échantillons
- Mettre en place les méthodes de traitement et d’interprétation des données générées
- Réaliser l’interprétation qualitative et quantitative des résultats
- Générer les rapports de résultats


Activités associées :
- Travail en collaboration entre 2 équipes de l’Institut RESTORE (METABOLINK et GOT-IT) et en interaction avec les autres partenaires du projet, ainsi qu’avec la plateforme MetaToul-METABOHUB (www.metatoul.fr)
- Gestion et organisation des moyens techniques, incluant gestion des matériels et consommables, entretien et maintenance des équipements, formation des utilisateurs aux techniques développées, commandes.
- Rédaction de rapports d’expérience ou d’étude, de notes techniques, de protocoles de laboratoires, participation à la rédaction de publications,
- Communication (interne et externe) sur les données expérimentales,
- Participation au fonctionnement collectif de l’équipe et du laboratoire (gestion des stocks de consommables, participation au suivi des équipements, participation aux réunions d’équipe, taches collectives).

Compétences

- Connaissance scientifique dans le domaine de recherche : biochimie, chimie analytique,
- Connaissances théoriques et pratiques en techniques analytiques, en particulier la résonance magnétique nucléaire
- Expérience dans la préparation des échantillons et l’analyse des données.
- Notions en mathématiques, méthodes statistiques et programmation informatique (R ou Python),
- Capacité d'organiser et de prioriser les tâches de travail et de fonctionner en tant que membre d'une équipe ; une expérience en gestion de projet serait un plus,
- Travail en milieu confiné, protégé (connaissance des règles d’hygiène et de sécurité liées à la manipulation de produits chimiques, produits à risque biologique),
- Communication, rédaction, transmission de savoir-faire technique,
- ANGLAIS : compréhension orale : niveau I – Compréhension écrire : niveau II

Contexte de travail

Ce poste s’inscrit dans le cadre du projet OPTI-STEM qui vise à démocratiser l’accès à la thérapie cellulaire en France et en Europe, dans le cadre de la stratégie d'accélération « Biothérapies et bioproduction de thérapies innovantes » financée par l’Etat via Bpifrance et par la région Occitanie. Le projet OPTI-STEM vise à optimiser la production de cellules stromales mésenchymateuses dérivées des tissus adipeux (ASC) afin d'en démocratiser l'accès et ainsi permettre la diversification des applications thérapeutiques de ce type de cellules et de leurs dérivés (exosomes, etc.). Ce projet comporte un volet important sur la connaissance du métabolisme des cellules, pour laquelle nous mettons en place des approches originales d’étude du métabolisme énergétique, et notamment du métabolisme rédox.

Ce poste s’inscrit dans le cadre du projet OPTI-STEM qui vise à démocratiser l’accès à la thérapie cellulaire en France et en Europe, dans le cadre de la stratégie d'accélération « Biothérapies et bioproduction de thérapies innovantes » financée par l’Etat via Bpifrance et par la région Occitanie. Le projet OPTI-STEM vise à optimiser la production de cellules stromales mésenchymateuses dérivées des tissus adipeux (ASC) afin d'en démocratiser l'accès et ainsi permettre la diversification des applications thérapeutiques de ce type de cellules et de leurs dérivés (exosomes, etc.). Ce projet comporte un volet important sur la connaissance du métabolisme des cellules, pour laquelle nous mettons en place des approches originales d’étude du métabolisme énergétique, et notamment du métabolisme rédox.

Contraintes et risques

La personne peut être amenée à travailler sur plusieurs sites : les sites RESTORE (Campus Oncopole et Campus Rangueil) et ceux de la plateforme MetaToul-MetaboHUB (Campus Rangueil). En particulier une partie importante du travail de la personne recrutée se déroulera sur le site MetaToul-Fluxomet localisé au sein de Toulouse Biotechnology Institute (UMR CNRS 5504)

La personne peut être amenée à travailler sur plusieurs sites : les sites RESTORE (Campus Oncopole et Campus Rangueil) et ceux de la plateforme MetaToul-MetaboHUB (Campus Rangueil). En particulier une partie importante du travail de la personne recrutée se déroulera sur le site MetaToul-Fluxomet localisé au sein de Toulouse Biotechnology Institute (UMR CNRS 5504)