Doctorant Spectroscopie Résolu en Temps de Nouvelles Protéines Photocommutables pour la Nanoscopie H/F
Le projet se focalisera sur le développement d'une variante fluorescente et photo-commutable de MSOX pour des applications en nanoscopie et ultimement en optogénétique. Pour ce faire, des acides aminés proche de la flavine, intervenant dans le mécanisme de quenching de fluorescence, seront modifiés et l'utilisation de molécules inhibiteurs alternatives sera explorée, ainsi que des sites modifiés de liaison de substrat. Ces complexes seront étudiés par spectroscopie transitoire d'absorption et de fluorescence.
1. Sorigué, D., Hadjidemetriou, K., Blangy, S., Gotthard, G., Bonvalet, A., Coquelle, N., et al. (2021). Mechanism and dynamics of fatty acid photodecarboxylase. Science, 372, eabd5687.
2. Zhuang, B., Ramodiharilafy, R., Liebl, U., Aleksandrov, A., & Vos, M. H. (2022). Ultrafast Photooxidation of Protein-Bound Anionic Flavin Radicals. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 119, e2118924119.
3. Zhuang, B., & Vos, M. H. (2022). Photoswitching Behavior of Flavin-Inhibitor Complex in a Nonphotocatalytic Flavoenzyme. J. Am. Chem. Soc., 144, 11569-11573
Contexte de travail
Le projet de thèse, financé par l'ANR, se déroulera au laboratoire d'Optique et Biosciences de l'Ecole Polytechnique (IP Paris), au sein du pole'Dynamique interne des molécules biologiques'. La thèse sera co-encadré par un spécialiste de la dynamique des protéines et un spécialiste des bio-photocommutateurs. Le projet bénéficie d'expertise en biochimie et en expression de protéines au sein du laboratoire, ainsi que d'approches complémentaires par nos partenaires externes, en modélisation par chimie quantique (Itodys Univ. Paris Cité) et cristallographie femtoseconde (IBS CEA Grenoble). Le candidat possède idéalement une formation en biophysique ou en physico-chimie, avec une expérience en spectroscopie ultrarapide et un intérêt pour la biochimie des protéines.
L'Ecole Polytechnique est située dans la région de Paris-Saclay, et est facilement accessible par transport depuis Paris. Plus d'informations disponibles sur https://www.ip-paris.fr. Le candidat rejoindra l'école doctorale de l'Institut Polytechnique de Paris.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
Contraintes et risques
Utilisation de lasers femtoseconde