Assistant Ingénieur en Microbiologie Environnementale H/F
Activités
- Collecte sur le terrain et traitement d'échantillon environnementaux (eau, biofilms aquatiques).
- Conduire un ensemble d'essais utilisant différentes techniques en adaptant les conditions expérimentales : Cytométrie ; Analyse de la biodiversité de communautés (metabarcoding) ; Analyse quantitative de l'imprégnation par l'antibiorésistance (ex. qPCR)
- Maintien de communautés collectées en microcosmes contrôlés
- Traiter, interpréter et mettre en forme les résultats, en garantir la qualité.
- Exploiter et présenter les résultats sous forme de synthèse.
- Rédiger les rapports d'avancement du projet.
Compétences
Microbiologiste de formation, le (la) candidat(e) devra présenter des compétences de base en biologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR). S'agissant d'un sujet centré sur la dissémination de l'antibiorésistance, il est attendu que la personne recrutée ait des connaissances sur les mécanismes de transfert de gènes horizontaux entre bactéries (conjugaison, transduction, transformation). En outre, cette personne devra pouvoir rendre compte des avancées de son travail à l'oral (présentation power point au consortium et devant l'équipe d'accueil) et par écrit (rapports de synthèse réguliers au consortium)
Contexte de travail
Le (la) lauréat(e) sera affecté(e) au LCPME (UMR 7564 UL-CNRS) qui regroupe 80 personnes distribuées dans trois équipes. La personne recrutée intègrera l'équipe Microbiologie Environnementale sur sa thématique "dissémination de l'antibiorésistance dans l'environnement" sous la direction de Christophe Merlin. Le projet auquel la personne recrutée sera affectée se déroulera dans le contexte d'une collaboration avec l'unité COLiPATH de l'Anses. De ce fait, de fortes interactions au sein du LCPME mais aussi entre partenaires seront attendues pour une progression harmonieuse du projet entre les membres du consortium.
Contraintes et risques
Flexibilité éventuelle des horaires de travail (sorties terrain)
Posséder le permis B sera apprécié