Ingénieur en Base de Données et Développement Informatique
Dans ce contexte, nous recrutons un∙e ingénieur∙e en base de données et développement informatique.
En tant qu’ingénieur∙e, vous participez au développement, à la validation et au maintien en condition opérationnelle d’une plateforme de gestion de données et processus de traitement d’imagerie médicale.
L’objectif est la mise au point d’algorithmes de segmentation des défauts de la substance blanche : hypersignaux, espaces périvasculaires, infarctus silencieux et micro-saignements. Dans ce contexte, la qualité et la cohérence des données utilisées pour développer ces algorithmes est d’une importance majeure.
Ce poste se découpe en deux activités principales :
1/ Architecture et environnement des système d’informations (langage de programmation, conception d’algorithmes)
2/ Développement logiciel et de calculs scientifiques (ingénierie, tests fonctionnels/techniques et lancement de calculs par Slum)
Vos missions se déclinent en différentes tâches telles que :
* La gestion et la validation des données d’imagerie de résonance magnétique transférées depuis les sites d'acquisition et des espaces de stockages externes vers la plateforme de gestion des données (SWOMED) ;
* Le traitement des données IRM pour l’extraction de biomarqueurs (prédiction et quantification) sur cluster HPC ;
* Le développement de scripts de traitement d’imagerie neurologique (basés sur Python) ;
* La gestion de bases de données d’imageries (archivage et documentation) ;
* La rédaction et la présentation orale de rapports d’analyses ;
* La participation à l’écriture d’articles scientifiques ainsi qu’aux réunions de travail ;
* Le travail en collaboration avec l’entreprise Fealinx, partenaire du projet.
Plusieurs bases de données d’imagerie seront utilisées pour ce projet, notamment MRi-Share (2000 sujets) et la UK-biobank (50000 sujets) pour la mise au point et la base données SHIVA pour l’analyse (400).
Vous êtes curieux∙euse d’en savoir plus ? Consultez des exemples de travaux via ces liens :