Ingénieur d'Étude en Biomicrofluidique H/F
- Concevoir et adapter les dispositifs expérimentaux en microfluidique et en colonnes de milieux poreux pour l'imagerie et l'étude de la communication bactérienne sous écoulement
- Mettre en oeuvre les expériences incluant la culture et l'inoculation des bactéries, et leur imagerie par fluorescence en 2D et 3D sous écoulement
- Traiter les images et analyser les données
Activités
L'ingénieur(e) d'étude mènera ses activités au sein du laboratoire Géosciences Rennes et de l'OSUR. Son activité principale sera de développer et optimiser les méthodes et les outils d'étude des processus de colonisation, croissance et communication de bactéries sous écoulement dans des bioréacteurs et dans des systèmes microfluidiques.
Compétences
Nous recherchons un ou une canditat.e possédant une excellente maîtrise des méthodes d'étude des interactions entre micro-organismes et écoulement de fluide
en conditions contrôlées. Une expérience en microfluidique avec des micro-organismes est demandée. Le ou la candidat(e) devra avoir un diplôme de master ou équivalent en microfluidique, biophysique, ingénierie biologique, microbiologie ou mécanique des fluides.
Contexte de travail
Ce travail est une collaboration entre le laboratoire de Géosciences de Rennes et l'Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse portant sur l'étude des couplages entre l'écoulement des fluides et les mécanismes contrôlant le développement des micro-organismes dans les milieux poreux. Plus précisément, ce projet vise à explorer comment les communications entre bactéries, en particulier le quorum sensing (QS), sont influencées par l'écoulement dans les milieux poreux. Les bactéries communiquent par l'intermédiaire de molécules de signalisation, appelées autoinducteurs, qui sont produites par les cellules bactériennes, transportées par l'écoulement, diffusent à travers les différentes phases et peuvent interagir avec la surface solide ou réagir.
Contraintes et risques
Le candidat retenu utilisera des bactéries de niveau de sécurité 1 et 2 pour les expériences. Pour cela il ou elle travaillera dans des laboratoires de biologie de niveau de sécurité adapté.